je suis justement confrontée au même problème avec mon cheval.
Dans son cas, c'est parce qu'il a les canines qui sont en train de percer, ça entraîne un oedème au palais (c'est ça, le lampas, en fait), donc ça devrait passer tout seul.
Mais ça peut également être lié à la nourriture, ou à des allergies effectivement (en tant qu'allergique humaine, je confirme que le palais qui gonfle, c'est assez courant). Il faut réussir à déterminer la cause exacte, mais si c'est les allergies, malheureusement c'est compliqué. Il faut déterminer l'allergie exacte, donc faire des tests en clinique, et ça coûte cher... puis faire une désensibilisation.
On peut contenir la situation en utilisant des anti-histaminiques, mais deux problèmes : les anti-histaminiques équins sont difficiles à trouver, et il y a un phénomène d'accoutumance.
Chercher du côté des médecines parallèles (shiatsu par ex), une allergie pouvant être causée par un déséquilibre interne...